Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms