Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms