Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms