Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms