Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms