Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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