Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms