Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms