Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms