Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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