Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms