Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms