Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Cldn19Q9ET38 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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Cldn19Q9ET38 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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