Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp29Q9ES63 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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