Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms