Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms