Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk3Q9ERH7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms