Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms