Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms