Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Barx1Q9ER42 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms