Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnn1Q9EQR3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnn1Q9EQR3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms