Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr6Q9EQ16 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cxcr6Q9EQ16 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcr6Q9EQ16 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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