Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms