Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms