Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sil1Q9EPK6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms