Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms