Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tomm20Q9DCC8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tomm20Q9DCC8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tomm20Q9DCC8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm20Q9DCC8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms