Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms