Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms