Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms