Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms