Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms