Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhc1Q9D9T8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms