Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmco5aQ9D9D5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco5aQ9D9D5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms