Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TcimQ9D915 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TcimQ9D915 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms