Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg7Q9D906 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms