Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms