Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hm13Q9D8V0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hm13Q9D8V0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hm13Q9D8V0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms