Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms