Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Q9D8Q6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Q9D8Q6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Q9D8Q6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Q9D8Q6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Q9D8Q6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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