Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh4Q9D8F1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms