Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kctd4Q9D7X1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kctd4Q9D7X1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kctd4Q9D7X1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kctd4Q9D7X1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms