Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms