Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms