Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms