Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtl8cQ9D6I0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl8cQ9D6I0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms