Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms