Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms