Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc81Q9D5W4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms