Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms